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NOVOS MARCADORES PARA FINS DE MAPEAMENTO E LOCALIZAÇÃO DE QTLs A PARTIR DE PCR-RFLP DE GENES DO GENOMA CAFÉ BRASILEIRO

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dc.contributor.author Colombo, Carlos Augusto en_US
dc.contributor.author Yamamoto, Paula Yuri en_US
dc.contributor.author Ramos, Luis Carlos S. en_US
dc.contributor.author Mazzafera, Paulo en_US
dc.contributor.author Gallo, Paulo Boller en_US
dc.contributor.author Vilella, Otávia T. en_US
dc.contributor.author Lannes, Sérgio D. en_US
dc.contributor.author Pot, David en_US
dc.contributor.author Ferreira, Lucia P. en_US
dc.contributor.author Vieira, Luiz Gonzaga E. en_US
dc.contributor.author Pereira, Luiz Filipe P. en_US
dc.contributor.other Embrapa - Café pt_BR
dc.date.accessioned 2015-01-14T13:50:19Z
dc.date.available 2015-01-14T13:50:19Z
dc.date.issued 2009 pt_BR
dc.identifier.citation Colombo, Carlos Augusto; Yamamoto, Paula Yuri; Ramos, Luis Carlos S.; Mazzafera, Paulo Gallo, Paulo Boller Vilella, Otávia T. Lannes, Sérgio D.; Pot, David; Ferreira, Lucia P.; Vieira, Luiz Gonzaga E.; Pereira, Luiz Filipe P. Novos marcadores para fins de mapeamento e localização de QTLs a partir de PCR-RFLP de genes do genoma café brasileiro. In: Simpósio de Pesquisa dos cafés do Brasil (6. : 2009 : Vitória, ES). Anais Brasília, D.F: Embrapa - Café, 2011 (1 CD-ROM), 5p. pt_BR
dc.identifier.uri http://www.sbicafe.ufv.br/handle/123456789/2741
dc.description Trabalho apresentado no Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (6. : 2009 : Vitória, ES). Anais Brasília, D.F: Embrapa - Café, 2011 pt_BR
dc.description.abstract O mapeamento genético é uma das estratégias mais visadas para fins de melhoramento genético e ganha maior importância a partir do surgimento de marcadores do tipo SNPs ou INDELs, facilitado pelos projetos genomas, sobretudo de ESTs. Assim, análises in silico de busca de polimorfismo SNPs em seqüências relacionadas com qualidade de bebida e derivadas de C.arabica e C.canephora foram analisadas e o polimorfismo entre as duas espécies validado para seis genes (quatro proteases e dois de sacarose) a partir de estudos de laboratório utilizando a técnica PCR-RFLP. Para tanto, após confirmação do polimorfismo nas duas espécies parentais, foram genotipadas 90 plantas F2 derivadas da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora 4x. Após a obtenção dos amplificados, estes foram digeridos com diversas enzimas de restrição de quatro bases (Alu I, Dde I, Eco RI, Hae III, Mse I e Msp, Fnu DII, Taq I; Scr FI). Dos seis genes analisados, quatro deles apresentaram segregação do tipo 3:1 na população F2 (Cisteína 8, Cisteína 5, β-Fructosidase e Sacarose Fosfato Sintase), demonstrando a utilização dos mesmos para fins de mapeamento. pt_BR
dc.description.abstract The genetic mapping strategy is very targeted for breeding and its importance is growing with the emergence of SNPs or INDELs markers, facilitated by the genome project, especially for ESTs. Thus, in silico analysis of polymorphic SNPs in sequences related to cup quality and derive from C.arabica and C.canephora were analyzed and the polymorphisms between the two species validated for six genes (four proteases and two sucrose) from laboratory studies using PCR-RFLP technique. Thus, after confirmation of polymorphism in both parental species, 90 F2 plants derived from self an interspecific hybrid of Coffea arabica and C. canephora 4x were genotyped. After obtaining the amplified, they were digested with various restriction enzymes of four bases (Alu I, DDE I, Eco RI, Hae III, Mse I and Msp, Fnu DII, Taq I, Scr FI). Of the six genes analyzed, four of them showed 3:1 segregation in the F2 population (Cysteine8, Cysteine 5, β-Fructosidase and sucrose phosphate synthase), demonstrating the use of them for mapping. Key words: Coffea spp., cup quality, assisted selection, restriction enzymes, ESTs, candidate genes. pt_BR
dc.description.sponsorship Embrapa - Café pt_BR
dc.language.iso pt_BR pt_BR
dc.subject Coffea spp., qualidade de bebida, seleção assistida, enzimas de restrição, ESTs, genes candidatos pt_BR
dc.subject Coffea spp., cup quality, assisted selection, restriction enzymes, ESTs, candidate genes pt_BR
dc.title NOVOS MARCADORES PARA FINS DE MAPEAMENTO E LOCALIZAÇÃO DE QTLs A PARTIR DE PCR-RFLP DE GENES DO GENOMA CAFÉ BRASILEIRO pt_BR
dc.title.alternative NEW MARKERS TO MAPPING AND LOCATION OF QTLS FROM THE BRAZILIAN COFFEE GENOME BASED ON PCR-RFLP pt_BR
dc.type Artigo pt_BR

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