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Biblioteca do Café

Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial

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dc.contributor.author Ivamoto, Suzana Tiemi
dc.contributor.author Reis Junior, Osvaldo
dc.contributor.author Carazzolle, Marcelo Falsarella
dc.contributor.author Domingues, Douglas Silva
dc.contributor.author Pereira, Luiz Filipe Protasio
dc.date.accessioned 2015-06-24T17:16:49Z
dc.date.available 2015-06-24T17:16:49Z
dc.date.issued 2013
dc.identifier.citation IVAMOTO, S. T. et al. Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2013, 5 p. pt_BR
dc.identifier.uri http://www.sbicafe.ufv.br:80/handle/123456789/3458
dc.description Trabalho apresentado no VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil pt_BR
dc.description.abstract Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos. pt_BR
dc.format 5 páginas pt_BR
dc.language.iso pt_BR pt_BR
dc.publisher Embrapa Café pt_BR
dc.subject RNA-Seq pt_BR
dc.subject Transcriptoma pt_BR
dc.subject Coffea arabica pt_BR
dc.subject Illumina pt_BR
dc.subject.classification Cafeicultura::Genética e melhoramento pt_BR
dc.title Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial pt_BR
dc.title.alternative Transcriptomic resources for early-stage fruit development of Coffea arabica L. pt_BR
dc.type Trabalho de Evento Científico pt_BR

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143_VIII-SPCB-2013.pdf 274.6Kb application/pdf Visualizar/Abrir ou Pre-visualizar

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