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Biblioteca do Café

Validação de marcadores microssatélites e diversidade genética de genótipos de Coffea arabica provenientes da Etiópia

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dc.contributor.author Silva, Bruna Silvestre Rodrigues da
dc.contributor.author Cação, Sandra Bellodi
dc.contributor.author Ferreira, Rafaelle Vecchia
dc.contributor.author Santos, Maria Aparecida
dc.contributor.author Ivamoto, Suzana Tiemi
dc.contributor.author Silva, Juliana Costa
dc.contributor.author Androcioli, Leonardo Godoy
dc.contributor.author Domingues, Douglas Silva
dc.contributor.author Leroy, Thierry
dc.contributor.author Charmetant, Pierre
dc.contributor.author Sera, Gustavo
dc.contributor.author Pereira, Luiz Filipe Protasio
dc.date.accessioned 2015-07-02T18:37:59Z
dc.date.available 2015-07-02T18:37:59Z
dc.date.issued 2015
dc.identifier.citation SILVA, B. S. R. et al. Validação de marcadores microssatélites e diversidade genética de genótipos de Coffea arabica provenientes da Etiópia. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015, 6 p. pt_BR
dc.identifier.uri http://www.sbicafe.ufv.br:80/handle/123456789/3664
dc.description Trabalho apresentado no IX Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil pt_BR
dc.description.abstract O café é uma valiosa commodity agrícola, sendo sua bebida uma das mais populares do mundo. Apesar do sucesso dos programas de melhoramento em Coffea arabica, o desenvolvimento de novas cultivares é demorado, podendo levar mais de 20 anos. Além disso, a estreita base genética de C. arabica pode dificultar a obtenção de cultivares resistentes a pragas e a doenças ou tolerantes a estresses abióticos. Os acessos selvagens de C. arabica geneticamente distantes das variedades cultivadas proporcionam novos alelos para enriquecer sua variabilidade genética. O objetivo deste trabalho foi validar marcadores moleculares do tipo SSR em um painel de 24 acessos de C. arabica da coleção da Etiópia, realizar um estudo da diversidade, estrutura e seleção de genótipos para futuros trabalhos de introgressão no melhoramento. Neste trabalho foram utilizados 58 marcadores microssatélites (SSR) obtidos de análises in silico a partir de dados de RNA-seq da cultivar Iapar 59 e de sequências de BACs de Hibrido de Timor 832/2, e 77 SSR obtidos de uma extensa revisão bibliográfica em C. arabica e/ou C. canephora. Dos 135 SSR utilizados, 122 resultaram em produtos de amplificação e 31 foram polimórficos no painel. Desses, 20 SSR foram altamente informativos com valores de PIC acima de 0,7, e sete são descritos pela primeira vez. Um total de 165 alelos foram obtidos com média de 5,3 alelos por loco. O estudo de diversidade e estrutura genética dos acessos separou os genótipos em três principais grupos. A utilização de marcadores SSR informativos assim como o estudo de diversidade e estrutura genética destes e dos demais acessos permitirá a criação de uma coleção nuclear, facilitando a conservação, acessibilidade e uso de recursos genéticos de cafeeiros da Etiópia. pt_BR
dc.format 6 páginas pt_BR
dc.language.iso pt_BR pt_BR
dc.publisher Embrapa Café pt_BR
dc.subject Marcadores pt_BR
dc.subject SSR pt_BR
dc.subject RNA-seq pt_BR
dc.subject BAC pt_BR
dc.subject.classification Cafeicultura::Genética e melhoramento pt_BR
dc.title Validação de marcadores microssatélites e diversidade genética de genótipos de Coffea arabica provenientes da Etiópia pt_BR
dc.title.alternative Microsatellite markers validation and genetic diversity of Coffea arabica genotypes from Ethiopia pt_BR
dc.type Trabalho de Evento Científico pt_BR

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