Os genes no locus SH3 são importantes para resistência duradoura dos cafeeiros à ferrugem, causada pelo fungo Hemileia vastatrix. Há um agrupamento de oito genes que codificam proteínas R da família CC-NBS-LRR no locus SH3 da variedade IAPAR59 de Coffea arabica. A sequência dessas proteínas R é variável, especialmente na região carboxiterminal, onde estão localizados motivos ricos em leucina (LRR) que participam do reconhecimento das diferentes raças do fungo. Os objetivos do trabalho foram investigar: 1) a estrutura do locus SH3 em C. arabica cv. Caturra e silvestre de origem etíope, em C. canephora DH200 94 e em C. eugenioides que tiveram os genomas sequenciados; e 2) a variabilidade da região carboxiterminal dos peptídeos deduzidos para todas as cópias dos genes R em loci SH3 desses quatro genótipos e de IAPAR59 e C. canephora IF200. Os peptídeos foram identificados, alinhados e agrupados pelo método de Fitch-Margoliash. Concluiu-se que o locus SH3 é complexo e multialélico em todos os genomas investigados. Há diferença no número de cópias e na organização e na sequência das cópias dos genes R nos loci SH3 dos diferentes genomas, características que podem estar associadas ao mecanismo de distinção e reconhecimento das raças fisiológicas de H. vastatrix pelas variedades de cafeeiros.