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Caracterização in silico de genes de expansina presentes em cafeeiro (Coffea arabica L.)

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dc.contributor.author Budzinski, Ilara G. F. pt_BR
dc.contributor.author Pereira, Luiz Filipe Protasio pt_BR
dc.contributor.author Vieira, Luiz Gonzaga Esteves pt_BR
dc.contributor.other Embrapa - Café pt_BR
dc.date 2007-11-23 11:50:20.867 pt_BR
dc.date.accessioned 2015-01-14T13:47:35Z
dc.date.available 2015-01-14T13:47:35Z
dc.date.issued 2007 pt_BR
dc.identifier.citation Budzinski, Ilara G. F.; Pereira, Luiz Filipe P.; Vieira, Luiz Gonzaga E. Caracterização in silico de genes de expansina presentes em cafeeiro (Coffea arabica L.). In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : Águas de Lindóia, SP : 2007). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa - Café, 2007. (1 CD-ROM), 5p. pt_BR
dc.identifier.other 179995_Art056 pt_BR
dc.identifier.uri http://www.sbicafe.ufv.br/handle/123456789/2427
dc.description Trabalho apresentado no Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : 2007 : Águas de Lindóia, SP). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007. pt_BR
dc.description.abstract As expansinas (EXPs) são proteínas que promovem o relaxamento e extensão da parede celular em plantas, sendo codificadas por uma multifamília gênica e classificadas em: [alfa]-expansinas, [beta]-expansinas, expansin-like A (EXLA) e expansin-like B (EXLB). Estas proteínas atuam no alongamento celular, maciez dos frutos, abscisão, germinação e polinização. As [alfa]-expansinas representam a maior família e relacionam-se diretamente com o controle da extensão da parede celular em processos de desenvolvimento. Visto que a maturação uniforme dos frutos de café contribui para a qualidade da bebida, este trabalho teve por objetivo identificar e caracterizar in silico genes de expansinas envolvidas neste processo. Através da mineração dos dados do Genoma Café foram encontrados 28 contigs referentes às EXPs, sendo dois contigs de EXLB, um de EXLA e os demais pertencentes à família das [alfa]-expansinas. Dentro desta ultima família foram identificados quatro contigs relacionados com o desenvolvimento dos frutos do cafeeiro. Comparação dos contigs obtidos nos bancos do Projeto Genoma Café e de contigs no banco de dados HarvEST Coffea permitiu a caracterização in silico da expressão dos contigs nos diferentes estádios de maturação dos frutos. pt_BR
dc.description.abstract Expansins (EXPs) are proteins that induce plant cell wall elongation and irreversible extension. They are encoded by a gene superfamily organized into four families: [alfa]-expansinas, [beta]-expansinas, expansin-like A (EXLA) and expansin-like B (EXLB). Expansins activity occurs in several plant physiological and developmental processes such as: fruit softening, abscission, seed germination and polinization. The [alfa]-expansinas represents the major gene family and are directly involved into the control of cell wall extension and in developmental processes. With the objective to study the role of EXP in coffee fruit maturation we selected EXP homologous sequences on the Brazilian Coffee Genome Project for in silico analysis. Clusterization of EXPs sequences identified 28 EXPs contigs, two from EXLB, one from EXLA, and 25 belonging to [alfa]-expansin family. Within the [alfa]-expansin family four contigs were identified as closely related to coffee fruits development. Data comparisons between the contigs present in the Genoma Café Project with contigs from HarvEST Coffea database allowed the in silico characterization of EXPs during fruit maturation. en
dc.description.sponsorship Embrapa - Café pt_BR
dc.language.iso pt_BR pt_BR
dc.subject Genoma Café Expansinas Frutos Desenvolvimento Maturação pt_BR
dc.subject Coffee Genome Expansins Fruit development Fruit maturation en
dc.subject.classification Genética, Melhoramento e Biotecnologia do Cafeeiro pt_BR
dc.title Caracterização in silico de genes de expansina presentes em cafeeiro (Coffea arabica L.) pt_BR
dc.title [In silico characterization of Coffea arabica expansins genes] en
dc.title.alternative [In silico characterization of Coffea arabica expansins genes] en
dc.type Artigo pt_BR

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